O Instituto Ecossis é patrocinador institucional do Projeto Monitoramento Mirim Costeiro, que desde 2012 desenvolve um programa pioneiro de educação socioambiental com todas as escolas municipais de Garopaba, transformando as crianças em “Guardiãs dos Oceanos”.
O programa envolve as crianças com os atuais problemas socioambientais relacionados aos oceanos, fomentando experiências de aprendizagem prática no ambiente costeiro. As crianças se tornam pesquisadoras e monitoras mirins do litoral onde vivem, conhecendo sobre as características desse ecossistema, sobre a cultura local e as atividades socioeconômicas exercidas em sua comunidade.
Atualmente o projeto está com uma campanha para arrecadação de fundos.